En la literatura hay descritos informes en relación al uso crónico de fluconazol a altas dosis en pacientes que presentaron meningitis coccidiodal y desordenes genéticos; estos son similares a los que se evidenciaron en animales de estudio después de la exposición in utero al fluconazol.
No siendo esto aplicable para el uso aislado de este medicamento, a dosis de 150 mg, donde los estudios no han demostrado efectos teratogénicos; debiendo destacar que la mayoría de estos estudios presentan un n pequeño.
Ante estos hallazgos se deberá prestar especial atención a la indicación del fluconazol en el primer trimestre del embarazo, optándose por planes terapéuticos alternativos.